临床个体化用药基因检测技术的临床应用

对许多药物来说，治疗选择依旧是一个重复尝试的过程，需求多次失败的实验才干在治疗反响和反作用之间抵达可接受的均衡，这些药物反响的个体间差别对临床医生来说是一个应战。1959年德国药理学家Friedrich Vogel提出遗传药理学（Pharmacogenetics）的概念，被定义为遗传对药物反响变更的研讨[1]。1997年，Marshall引入了药物基因组学（Pharmacogenomics, PGx）的术语，意味着人们具有评价整个基因组的学问和技术，能够研讨多个基因对药物的影响[2]。2001年人类基因组草图的发布，是人类基因组计划胜利的里程碑事情，拉开了人类基因组学研讨和临床转化的大幕。这20年间，人类基因组信息的完成，以及新的基因分型和测序技术的呈现，直接或间接性的引领多个范畴和行业的快速展开。

一、常用的基因多态性检测技术

自2015年美国启动“精准医疗计划”，世界各国掀起了精准医疗热潮。其中基因检测技术的不时更新是推进精准医疗展开的关键。常用于基因多态性检测的措施包含实时荧光PCR法、荧光原位杂交法（Fluorescence In Situ Hybridization，FISH）、Sanger测序法、基因芯片法、高通量测序法、核酸质谱以及新兴的分子POCT检测技术平台等。

1．实时荧光PCR法：实时荧光PCR法是指经过对PCR扩增反响中每一个循环产物荧光信号中止实时监测从而完成对起始模板定性及定量剖析[4]。依据检测原理的不同，实时荧光PCR法可分为探针法和荧光染料法两种。实时荧光PCR法因具有灵活度高，分型精确，操作烦琐快捷，结果讲演疾速，所用仪器容易提高，易于推行运用等特性，被普遍应用临床药物基因组的检测之中，如SNPs、Indel、CNV、基因表白的剖析以及HLA-B分型检测等。截止到2021年5月31日，国度药品监视管理局（National Medical Products Administration，NMPA）已批准的药物基因组相关的第三类体外诊断试剂（In Vitro Diagnosis，IVD）中，接近2/3的产品（60/92）运用的是实时荧光PCR技术，触及检测的基因包含CYP2C19、CYP2C9、CYP2D6、SLCO1B1、MTHFR、UGT1A1等（http://app1.nmpa.gov.cn）。

2．FISH法：FISH法是20世纪80年代末在放射性原位杂交技术基础上展开起来的一种非放射性分子生物学和细胞遗传学分离的新技术，是以荧光标记取代同位素标记而构成的一种新的原位杂交措施。该措施应用已知DNA变异序列，与被检测的样本DNA序列杂交、互补配对，从而发现样本DNA的异常状况。在药物代谢酶和靶点基因检测中，FISH法主要用于测定基因扩增和基因缺失异常[5]。

3．Sanger测序法：Sanger测序法也称直接测序、一代测序法，1977年由Sanger等发明，尔后经过不时展开和改进，现今的Sanger测序技术已完成了自动化，采用四色荧光染料对ddNTP标记，毛细管电泳分别DNA片段，测序的方便性、保险性、通量均得到大大进步。Sanger法测序是DNA序列剖析的经典措施，由于该措施可直接读取DNA的序列，因而被以为是基因分型的金规范[6]。Sanger测序法适用于SNP、短串联重复序列多态性（Short Tandem Repeats，STR）、Alu重复序列多态性以及HLA-B分型检测。目前，已有多个基于Sanger测序法的第三类IVD试剂经过了NMPA审批，触及UGT1A1、ALDH2、MTHFR、CYP2C19、CYP2C9、VKORC1等基因位点的检测。

4．基因芯片：基因芯片又称DNA芯片法，是以特定的寡核苷酸片段作为探针，将其依照一定的次第固定于支持物上，然后将样品DNA经过PCR扩增、荧光标记等过程，按碱基互补配对的原理与芯片杂交，再经过荧光检测系统对荧光信号中止检测和剖析，从而取得个体的基因型信息。该措施既能够中止SNP基因型剖析，也可中止小至几kb的染色体拷贝数变异剖析[7]。我国NMPA已批准多种用于药物代谢酶和药物作用靶点基因多态性检测的基因芯片试剂盒，如CYP2C9、CY2C19、CYP2D6、ADRB1、AVKORC1、IL28B、APOE、G6PD等。

5、高通量测序法：高通量测序又被称为下一代测序（NGS）或大范围平行测序（MPS），是继Sanger测序的反动性进步，采用平行测序的理念，能够同时对上百万以至数十亿个DNA片段中止测序，完成了大范围、高通量测序的目的[8]。目前主流的商品化NGS技术主要有Illumina公司的Solexa技术和Thermo公司的Ion Torrent技术。高通量测序法主要的优点是可对目的中止高通量的检测，能同时中止SNP、CNV、STR、Alu、HLA-B分型检测；缺陷是仪器贵重，试剂成本高，检测流程复杂，对实验室环境和操作人员的请求较高，数据剖析难度大，不易于推行。主要适用于多个基因区域的基因变异的检测或低含量的突变检测等。

6．核酸质谱技术：核酸质谱技术是基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）技术原理，兼具PCR、芯片与质谱三大技术优势，是检测十几到几百个基因位点性价比较高的中通量基因检测技术[9]；比较成熟的核酸质谱平台为基纳（Agena Bioscience）公司的MassARRAY平台。核酸质谱技术分型精确，通量大，可中止多达30~40重的多重反响，可检测多等位基因SNPs，引物合成成本低；缺陷是需求特殊的仪器设备，操作流程略显繁琐，多重反响体系设计难度高。该措施比较合适中低通量的SNP、甲基化的检测。

7．分子POCT检测技术：分子POCT检测技术并不是一种特定的检测措施学平台，而是一种应用方式，强调检测产品的快速、粗笨和易行。无论IVD产品基于何种措施学，只需其产品特性契合“小、快、灵”的特性，都能够归入POCT的范畴。目前已被用于分子POCT检测的技术有胶体金层析、微流控芯片及小型一体化核酸检测平台等。国外POCT产品多采用集成式的一体化试剂盒，其开发技术门槛相对较高。而国内企业多采用一步法样本处置或者免提取等技术，减少人工操作流程，从而抵达POCT的目的[10,11]。

在用于药物代谢酶和药物作用靶点基因检测时，不同的技术措施都具有各自的优缺陷，适用于不同的检测目的和应用场景。同时，随着科学展开与技术进步，一些新兴的技术不时呈现，如RPA[12-14]、CRISPR-Cas[15-18]等，这些技术具有恒温扩增、灵活度高、扩增效率高、检测时间短等特性，也必会在未来的基因检测范畴发挥出严重的作用。

二、临床个体化用药的应用现状

1．Pharm GKB：药物基因学学问库（Pharmacogenomics Knowledgebase, Pharm GKB, www.pharmgkb.org/）对包含药理学信息的药物标签中止注释。这些信息已得到美国食品药品监视管理局（FDA）、欧洲药品管理局（EMA）、瑞士治疗产品管理局（swissmedicc）、加拿大卫生部（HCSC）及药品和医疗器械管理局日本（PMDA）的批准。截止到2021年5月，收录药物阐明书409种，其中FDA 371种、EMA 140种、Swissmedic 131种、HCSC 109种、PMDA 52种。药物基因学学问库收录了临床药物遗传学实施联盟（Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium, CPIC）、荷兰皇家药物促进协会-药物遗传学工作组（Dutch Pharmacogenetics Working Group, DPWG）、加拿大药物保险药物基因组学网络（Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety, CPNDS）和其他专业协会发布的基于PGx的药物剂量引荐指南。

Pharm GKB对配对的基因-药物临床注释证据中止分级，Level 1表示证据最强，Level 4证据最低，截止到2021年5月，1A级证据的药物有73个。由于药物遗传等位基因频率在不同种族人群之间存在显著差别，因而各个国度关于某个药物的分级也有不同。CPIC同样将证据等级分为A级（开处方时倡议思索基因信息）到D级（证据单薄或存在相互矛盾），截至2021年5月，CPIC发布了26份指南，掩盖20个基因，超越65个药物，均为Level 1A证据级别。这些引荐能够作为药物基因检测临床实施的重要参考。但仍有许多药物，数据有限，缺乏以支持应用到临床理论中。这篇综述主要参考PharmGKB和CPIC指南中止描画。

2．临床常用药物的个体化用药倡议 ：药物基因组学的重点是辨认影响药物治疗反响的基因变异，通常是经过改动药物动力学，即药物的吸收、散布、代谢或在药效学上经过改动其作用靶点和干扰影响患者对药物敏理性的生物途径而完成。

（1）心脑血管药物：心血管疾病是我国发病率与死亡率最高的疾病，并呈逐年上升趋向[32]。随着药物基因组学得展开，个体化用药基因检测已普遍应用于心血管常见药物如抗血小板、抗凝血、抗高血压、他汀类和抗心律失常等药物的临床理论。氯吡格雷为前药，自身无活性，需经两步活化过程生成活性硫醇代谢物发挥抑止血小板汇集的作用，细胞色素P450酶（CYP）2C19、CYP3A4、CYP2B6、CYP1A2、CYP2B9、对氧磷酶1（PON1）和羧酸酯酶1（CES1）等代谢酶参与其活化过程，其中CYP2C19作为参与两个活化步骤的关键酶，对氯吡格雷的活化至关重要，CYP2C19基因多态性已被普遍用于氯吡格雷的临床前检测[33]。美国分子病理学协会（the US Association of Molecular Pathology）引荐检测CYP2C19*1-3和*17等位基因，依据不同星型等位基因变异组合而成的CYP2C19代谢酶活性大小指导能否选用氯吡格雷[34,35]。阿司匹林相关基因多态性检测证据较高的为HLA-DPB1基因检测，与阿司匹林所致哮喘风险相关[36]。

CYP2D6基因编码的CYP2D6酶是机体重要的代谢酶之一，可参与目前经批准上市的21%的药物的代谢过程，如β-受体阻滞剂美托洛尔、钠通道阻滞剂氟卡尼和普罗帕酮等[37]。目前CYP2D6具有高度多态性的等位基因单倍型超越130个，如*1、*2、*33、*35为功用正常的等位基因，*9、*10、*17、*29、*36、*41是功用降低的等位基因，*3-8、*11-16、*19-21、*38、*40、*42为无功用等位基因[37]。大多数CYP2D6等位基因表示为SNPs或插入/缺失，也存在CNV和其他结构变异，其等位基因的缺失和重复在东亚人群中突变频率极低，普通不归入临床检测[38]。心血管常用药物证据级别较高代谢酶还有CYP2C9，其基因多态性与苯妥英血药浓度及不良反响有关[39]。

此外，转运蛋白和药物作用靶点的基因多态性同样是心血管常用药物临床选择及剂量调整的重要依据。证据级别较高的如溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1B1（SLCO1B1）与ATP分离盒转运蛋白超家族成员2（ABCG2）作为药物转运蛋白，可诱导血浆药物浓度的变更，其基因多态性是对他汀类药物反响的重要预测因子[40, 41]。驱动蛋白分子6（KIF6）和载脂蛋白E（ApoE）参与动脉粥样硬化的病理生理过程，其基因多态性招致个体间他汀类药物药效的差别[42, 43]。维生素K环氧化物恢复酶复合体1（VKORC1）和血管慌张素转化酶（ACE）分别作为华法林与卡托普利的作用靶点，其基因多态性与药物的剂量调整密切相关[44, 45]。

目前心血管常见药物基因检测曾经被普遍应用于PCI术后氯吡格雷有效性预测、华法林剂量调整及他汀类药物耐受性选择等临床理论，大量研讨聚焦于发现可预测心血管常用药物PK/PD的生物标记物，但由于证据级别较低，仍需求多中心、大样本随机对照实验的考证。

（2）免疫抑止药：目前常用的免疫抑止类药物主要包含他克莫司（Tacrolimus, TAC）、环孢素（Cyclosporine, CsA）、西罗莫司（Sirolimus, SIR）、糖皮质激素类药物（glucocorticoids）、吗替麦考酚酯（Mycophenolate mofetil, MMF）、硫唑嘌呤（Azathioprine, AZA）等，其代谢存在明显的个体差别，这与不同个体药物代谢相关基因的差别有密切关系。AZA是目前FDA请求检测的唯逐一个免疫抑止药。TPMT和NUDT15基因的多态性与AZA招致的骨髓抑止关系较为明白，证据等级较高[46]。而关于亚洲人群来说，NUDT15功用缺失等位基因的突变频率远高于TPMT[47]，更具参考价值。遗传差别如CYP3A5和CYP3A4单核苷酸多态性是招致TAC应用个体差别最主要的缘由，能够解释56~59％的TAC剂量和肃清率的变异性[48,49]。CsA药物基因组学研讨较TAC少，主要集中在ABCB1和CYP3A5[50,51]。研讨报道SIR和依维莫司的PK和不良反响可能与CYP3A5、ABCB1、CYP3A4的多态性有关[52,53]，与MMF 的PK/PD和不良反响有关的基因有IMPDH2、UGT1A8、ABCB1、IL10等[54]，但这些证据的引荐级别较低，也无明白的引荐意见，需求中止更深化的研讨，以确认其临床价值。但是这类药物大部分能够经过TDM中止有效地监测，以辅佐临床医生更合理用药。

（3）神经肉体类药物：神经肉体类药物代谢相关基因的遗传变异，对立肉体疾病药物的选择及剂量调整有重要作用，以增强治疗效果，降低不良反响。CPIC、DPWG、CPNDS等研讨机构对部分抗肉体失常药物给出了个体化用药倡议[55-58]，依据基因型预测同时分离TDM调整剂量，关于长期服药的患者尤为适用。目前证据级别比较高相关基因集中在CYP2D6、CYP2C19、HLA-B等。目前CYP2D6具有高度多态性的等位基因很多，变异方式多样，这样的状况招致该基因的临床检测和剖析较为艰难。固然CPIC对14个抗肉体失常药物中止剂量引荐，但是并没有请求需求检测哪些等位基因，也增加各个实验室之间检测的内容有差别[38]。

丙戊酸是常用的心情稳定剂和抗癫痫药物，目前FDA 倡议运用丙戊酸前应中止 POLG 基因检测，并遏止对发作 POLG 基因突变的患者运用丙戊酸[59]，但是该基因在中国人群中的突变频率较低。卡马西平、奥卡西平和苯妥英的不良反响与HLA-B *15:02:01相关，HLA-B *15:02:01阳性患者运用此类药物可能会引发严重的皮肤过敏反响，如 Stevens Johnson综合征（SJS）和中毒性表皮坏死溶解症（TEN）。亚洲人特别是中国人中HLA-B *15:02:01的携带者约有 10%~15% ，倡议在用药前中止该基因检测[60,61]。此外HLA-A *31:01:02携带者发作卡马西平所致严重皮肤反响的风险增高，除非获益大于风险，否则避免运用。

（4）抗肿瘤药物：本次主要引见临床运用比较普遍的传统化疗药物，如伊立替康，甲氨蝶呤，他莫昔芬，氟尿嘧啶等，关于新型的靶向抗肿瘤药物并未触及。此类药物的不良反响及药物代谢方面都存在明显的个体差别，这与个体间药物基因型不同有关。伊立替康（CTP-11）是临床上晚期大肠癌的一线用药，对肺癌、乳腺癌、胰腺癌等也有一定疗效。关于运用CPT-11化疗的亚洲人群，UGT1A1*6、*28基因突变纯合型患者发作腹泻和中性粒细胞减少的风险最高，其次为突变杂合型，而野生型最低[62]。2019年中国临床肿瘤学会（CSCO）相关指南也指出，UGT1A1*6、*28纯合突变型或双杂合突变型肿瘤患者应减少CPT-11剂量，以降低不良反响发作的风险[63]。他莫昔芬（TAM）作为乳腺癌内分泌治疗的一线药物，关于其基因多态性的研讨集中在CYP3A4、CYP3A5、CYP2D6、CYP2C19、SULT1A1等，其中以CYP2D6的证据级别最高，与疾病复发可能性有关，但目前并没有写入临床指南 [64-65]。氟尿嘧啶（FU）基因多态性的研讨大多聚焦于预测其疗效或不良反响的基因，包含DPYD、TYMS、MTHFR、GSTP1等。固然DPYD证据级别最高，与FU不良反响的发作率密切相关，但是中国人群的突变率极低，而突变率较高的DPYD rs1801159无典型的临床意义[66-67]。甲氨蝶呤代谢通路上的相关基因十分多，主要关注亚甲基四氢叶酸（methylene tetrahydrofolate reductase, MTHFR）恢复酶编码基因MTHFR C677T 和 A1298T的基因多态性[68-69]，其临床指导意义有限，十分有必要分离甲氨蝶呤24h、48h、72h的TDM结果及时挽救处置。ABCC2、ABCC6和ACSS2与多西他赛的代谢和毒性相关，但证据级别较低。关于这些药物能够经过TDM中止浓度和疗效的监测，更好地辅助临床，促进合理用药及个体化治疗。

（5）其他：除上述药物外，伏立康唑的代谢的PK参数与CYP2C19*1, CYP2C19*2, CYP2C19*3, CYP2C19*17密切相关[70]。奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑的疗效和代谢亦遭到CYP2C19*1, CYP2C19*2, CYP2C19*3, CYP2C19*17基因多态性的影响[71]。塞来昔布、氯诺西康、美诺西康的代谢差别可由CYP2C9*1, CYP2C9*2, CYP2C9*3基因多态性来解释[72]。麻醉类药物地氟醚、安氟醚、氟烷，异氟醚、七氟醚等毒性与RYR1基因多态性有关[73,74]。别嘌呤醇可惹起严重的可能致命皮肤不良反响，台湾研讨者率先证明了HLA-B*5801等位基因与别嘌呤醇诱导的SJS和TEN的发作相关。美国风湿病学会 (ACR) 倡议东南亚和非裔美国人在运用别嘌呤醇治疗前，应检测HLA-B*5801等位基因[75]。中国汉族人群HLA-B*5801的基因频率约为6.00%，用药前中止HLA-B*5801等位基因阳性筛查是比较有意义。

三、临床个体化用药的局限性及应用前景

人类全基因组序列的取得，使剖析人类基因组序列变更对严重疾病发病机制和药物治疗反响的影响成为可能。固然药物标签归入相关药物遗传信息和倡议，大量临床研讨提供了基因型和药物反响之间的因果关系，但并未让临床医生称心。此外，一些药物基因组学的研讨仍无法转化至临床理论。依然面临诸多的影响要素，好比检测费用较高，短少个体化用药倡议，临床医生对基因变异解读的才干有限，短少基于基因组学的临床决策支持系统，高质量的临床研讨较少等[76-78]。

随着基因组检测技术和剖析措施的进步，从群体未知的全基因组数据中，找到对应的药物反响表型并作考证是比较艰难的过程。而且一个特定药物在临床中受多个基因调控，一个基因能够影响多个药物，单个SNP可能缺乏以将目的蛋白的变更与疾病或药物反响联络起来，因而，检测含多个药物基因变异的panel，适用于服用多个药物的患者，如老年人。但是这样的检测伎俩目前并不普遍，一是需求树立多个基因位点的效应模型，依据权重计算评分，更科学地出具个体化用药倡议，二是需求中止药物遗传变异检测的成本-效益剖析，以充沛权衡药物基因检测实施的可行性，并希望促进更普遍的报销制度。但是随着基因分型检测成本的快速降落，许多成本-效益研讨很快便无参考价值。相关于基因检测，TDM单次检测费用较低，且更容易完成操作，因而依据TDM中止剂量调整比取得基因分型更易接受。

药物基因组学并不是药物反响的独一决议要素，必须将人口要素、环境要素、临床生理病理状态等思索在内，只需对一切要素中止综合评价，才能够胜利地完成个体化药物治疗。同时应用信息化支撑的数据库，不停地中止机器学习，构成临床决策支持系统，满足临床医生的请求。

参考文献

[1]VOGEL, F. Moderne probleme der Humangenetik[J]. Ergeb. Inn. Med.Kinderheilkd. 1959,12: 52-125.

[2]MARSHALL,A. Genset-Abbott deal heralds pharmacogenomics era[J]. Nat.Biotechnol.1997, 15:829-30.

[3]RODEN DM, GEORGE Jr AL. The genetic basis of variability in drug responses[J]. Nat Rev Drug Discov. 2002,1:37-44.

[4]YENGI L G. Systems biology in drug safety and metabolism: integration of microarray, real-time PCR and enzyme approaches [J]. Pharmacogenomics, 2005, 6(2): 185-92.

[5]QIAO Y, LIU X, HARVARD C, et al. Large-scale copy number variants (CNVs): distribution in normal subjects and FISH/real-time qPCR analysis [J]. BMC Genomics, 2007, 8: 167.

[6]TIPU H N, SHABBIR A. Evolution of DNA sequencing [J]. J Coll Physicians Surg Pak, 2015, 25(3): 210-5.

[7]BRAZEAU D A. Combining genome-wide and targeted gene expression profiling in drug discovery: microarrays and real-time PCR [J]. Drug Discov Today, 2004, 9(19): 838-45.

[8]MORGANTI S, TARANTINO P, FERRARO E, et al. Next Generation Sequencing (NGS): A Revolutionary Technology in Pharmacogenomics and Personalized Medicine in Cancer [J]. Adv Exp Med Biol, 2019, 1168: 9-30.

[9]GABRIEL S, ZIAUGRA L, TABBAA D. SNP genotyping using the Sequenom MassARRAY iPLEX platform [J]. Curr Protoc Hum Genet, 2009, Chapter 2: Unit 2 12.

[10]CRAW P, BALACHANDRAN W. Isothermal nucleic acid amplification technologies for point-of-care diagnostics: a critical review [J]. Lab Chip, 2012, 12(14): 2469-86.

[12]JAMES A, MACDONALD J. Recombinase polymerase amplification: Emergence as a critical molecular technology for rapid, low-resource diagnostics [J]. Expert Rev Mol Diagn, 2015, 15(11): 1475-89.

[13]LI J, MACDONALD J, VON STETTEN F. Review: a comprehensive summary of a decade development of the recombinase polymerase amplification [J]. Analyst, 2018, 144(1): 31-67.

[14]SHARAFDARKOLAEE S H, GILL P, MOTOVALI-BASHI M, et al. Isothermal Amplification Methods for the SNP Genotyping [J]. Curr Mol Med, 2019, 19(7): 461-72.

[15]GOOTENBERG J S, ABUDAYYEH O O, KELLNER M J, et al. Multiplexed and portable nucleic acid detection platform with Cas13, Cas12a, and Csm6 [J]. Science, 2018, 360(6387): 439-44.

[16]CHEN Y, MEI Y, JIANG X. Universal and high-fidelity DNA single nucleotide polymorphism detection based on a CRISPR/Cas12a biochip [J]. Chem Sci, 2021, 12(12): 4455-62.

[17]LI L, LI S, WU N, et al. HOLMESv2: A CRISPR-Cas12b-Assisted Platform for Nucleic Acid Detection and DNA Methylation Quantitation [J]. ACS Synth Biol, 2019, 8(10): 2228-37.

[18]LI S Y, CHENG Q X, WANG J M, et al. CRISPR-Cas12a-assisted nucleic acid detection [J]. Cell Discov, 2018, 4: 20.

[19]MEHROTRA M. PCR-Based Detection of DNA Copy Number Variation [J]. Methods Mol Biol, 2016, 1392: 27-32.

[20]KIM J W, KIM J H, IM S A, et al. HER2/CEP17 ratio and HER2 immunohistochemistry predict clinical outcome after first-line trastuzumab plus taxane chemotherapy in patients with HER2 fluorescence in situ hybridization-positive metastatic breast cancer [J]. Cancer Chemother Pharmacol, 2013, 72(1): 109-15.

[21]ROSKOSKI R, JR. Anaplastic lymphoma kinase (ALK): structure, oncogenic activation, and pharmacological inhibition [J]. Pharmacol Res, 2013, 68(1): 68-94.

[22]SONG C, LI X, MAO P, et al. Impact of CYP2C19 and CYP2C9 gene polymorphisms on sodium valproate plasma concentration in patients with epilepsy [J]. Eur J Hosp Pharm, 2020.

[23]LIU W, CHANG L W, XIE M, et al. Correlation between UGT1A1 polymorphism and neonatal hyperbilirubinemia of neonates in Wuhan [J]. J Huazhong Univ Sci Technolog Med Sci, 2017, 37(5): 740-3.

[24]GAO J, ZHOU J, LI Y, et al. UGT1A1 6/28 polymorphisms could predict irinotecan-induced severe neutropenia not diarrhea in Chinese colorectal cancer patients [J]. Med Oncol, 2013, 30(3): 604.

[25]LIN P, LI H, YU T, et al. The Effect of Angiotensin-Converting Enzyme Gene Polymorphisms on the Clinical Efficacy of Perindopril Prescribed for Acute Myocardial Infarction in Chinese Han Patients [J]. Genet Test Mol Biomarkers, 2019, 23(5): 316-24.

[26]SCHWARZ U I, GULILAT M, KIM R B. The Role of Next-Generation Sequencing in Pharmacogenetics and Pharmacogenomics [J]. Cold Spring Harb Perspect Med, 2019, 9(2): a033027.

[27]BEHJATI S, TARPEY P S. What is next generation sequencing? [J]. Arch Dis Child Educ Pract Ed, 2013, 98(6): 236-8.

[28]SU Z, NING B, FANG H, et al. Next-generation sequencing and its applications in molecular diagnostics [J]. Expert Rev Mol Diagn, 2011, 11(3): 333-43.

[29]RADPOUR R, KOHLER C, HAGHIGHI M M, et al. Methylation profiles of 22 candidate genes in breast cancer using high-throughput MALDI-TOF mass array [J]. Oncogene, 2009, 28(33): 2969-78.

[30]FLEITAS T, IBARROLA-VILLAVA M, RIBAS G, et al. MassARRAY determination of somatic oncogenic mutations in solid tumors: Moving forward to personalized medicine [J]. Cancer Treat Rev, 2016, 49: 57-64.

[31]DING S, CHEN R, CHEN G, et al. One-step colorimetric genotyping of single nucleotide polymorphism using probe-enhanced loop-mediated isothermal amplification (PE-LAMP) [J]. Theranostics, 2019, 9(13): 3723-31.

[32]胡盛寿, 高润霖, 刘力生,等. 《中国心血管病讲演2018》概要 [J]. 中国循环杂志, 2019, 34(03): 209-20.

[33]PRASAD K, SIEMIENIUK R, HAO Q, et al. Dual antiplatelet therapy with aspirin and clopidogrel for acute high risk transient ischaemic attack and minor ischaemic stroke: a clinical practice guideline [J]. BMJ, 2018, 363: k5130.

[34]PRATT V M, DEL TREDICI A L, HACHAD H, et al. Recommendations for Clinical CYP2C19 Genotyping Allele Selection: A Report of the Association for Molecular Pathology [J]. J Mol Diagn, 2018, 20(3): 269-76.

[35]MEGA J L, CLOSE S L, WIVIOTT S D, et al. Cytochrome p-450 polymorphisms and response to clopidogrel [J]. N Engl J Med, 2009, 360(4): 354-62.

[36]LEE H Y, LEE J W, LEE K W, et al. The HLA allele marker for differentiating ASA hypersensitivity phenotypes [J]. Allergy, 2009, 64(9): 1385-7.

[37]SARAVANAKUMAR A, SADIGHI A, RYU R, et al. Physicochemical Properties, Biotransformation, and Transport Pathways of Established and Newly Approved Medications: A Systematic Review of the Top 200 Most Prescribed Drugs vs. the FDA-Approved Drugs Between 2005 and 2016 [J]. Clin Pharmacokinet, 2019, 58(10): 1281-94.

[38]PRATT V M, CAVALLARI L H, DEL TREDICI A L, et al. Recommendations for Clinical CYP2D6 Genotyping Allele Selection: A Joint Consensus Recommendation of the Association for Molecular Pathology, College of American Pathologists, Dutch Pharmacogenetics Working Group of the Royal Dutch Pharmacists Association, and European Society for Pharmacogenomics and Personalized Therapy [J]. J Mol Diagn, 2021.

[39]KARNES J H, RETTIE A E, SOMOGYI A A, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2C9 and HLA-B Genotypes and Phenytoin Dosing: 2020 Update [J]. Clin Pharmacol Ther, 2021, 109(2): 302-9.

[40]BAI X, ZHANG B, WANG P, et al. Effects of SLCO1B1 and GATM gene variants on rosuvastatin-induced myopathy are unrelated to high plasma exposure of rosuvastatin and its metabolites [J]. Acta Pharmacol Sin, 2019, 40(4): 492-9.

[41]LEE H K, HU M, LUI S, et al. Effects of polymorphisms in ABCG2, SLCO1B1, SLC10A1 and CYP2C9/19 on plasma concentrations of rosuvastatin and lipid response in Chinese patients [J]. Pharmacogenomics, 2013, 14(11): 1283-94.

[42]LI Y, SABATINE M S, TONG C H, et al. Genetic variants in the KIF6 region and coronary event reduction from statin therapy [J]. Hum Genet, 2011, 129(1): 17-23.

[43]THOMPSON J F, HYDE C L, WOOD L S, et al. Comprehensive whole-genome and candidate gene analysis for response to statin therapy in the Treating to New Targets (TNT) cohort [J]. Circ Cardiovasc Genet, 2009, 2(2): 173-81.

[44]JACOBSEN P, ROSSING K, ROSSING P, et al. Angiotensin converting enzyme gene polymorphism and ACE inhibition in diabetic nephropathy [J]. Kidney Int, 1998, 53(4): 1002-6.

[45]JOHNSON J A, CAUDLE K E, GONG L, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for Pharmacogenetics-Guided Warfarin Dosing: 2017 Update [J]. Clin Pharmacol Ther, 2017, 102(3): 397-404.

[46]Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) guideline for thiopurine dosing based on TPMT and NUDT15 genotypes: 2018 update[J]. Clinical pharmacology and therapeutics, 2018.

[47]YANG J, WANG P, QIN Z, et al. NUDT15 and TPMT Genetic Polymorphisms Are Related to Azathioprine Intolerance in Chinese Patients with Rheumatic Diseases[J]. Genetic Testing and Molecular Biomarkers, 2019, 23(10): 751-7.

[48]ANDREU F, COLOM H, ELENS L, et al. A New CYP3A5*3 and CYP3A4*22 Cluster Influencing Tacrolimus Target Concentrations: A Population Approach[J]. Clinical Pharmacokinetics, 2017.

[49]JONGE H D, LOOR H D, VERBEKE K, et al. In Vivo CYP3A4 Activity, CYP3A5 Genotype, and Hematocrit Predict Tacrolimus Dose Requirements and Clearance in Renal Transplant Patients[J]. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2012, 92.

[50]EL-SHAIR S, ZIHLIF M, SHHAB M A, et al. Association Between CYP3A4 and CYP3A5 Genotypes and Cyclosporine's Blood Level and Doses Among Jordanian Kidney Transplanted Patients[J]. Current Drug Metabolism, 2019, 20(8).

[51]RAHSAZ M, AZARPIRA N, NIKEGHBALIAN S, et al. Association between tacrolimus concentration and genetic polymorphisms of CYP3A5 and ABCB1 during the early stage after liver transplant in an Iranian population[J]. Experimental and clinical transplantation: official journal of the Middle East Society for Organ Transplantation, 2012, 10(1): 24-9.

[52]EMOTO C, FUKUDA T, VENKATASUBRAMANIAN R, et al. The impact of CYP3A5*3 polymorphism on sirolimus pharmacokinetics: insights from predictions with a physiologically-based pharmacokinetic model[J]. British Journal of Clinical Pharmacology, 2016, 80(6):1438-46.

[53]HIDEAKI K, TAKENORI N, MITSURU S, et al. Prediction of Tacrolimus Exposure by CYP3A5 Genotype and Exposure of Co-Administered Everolimus in Japanese Renal Transplant Recipients[J]. International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19(3): 882.

[54]LIZOTTI C H, OLIVEIRA C, DE S, et al. Polymorphisms in IMPDH2, UGT2B7, and CES2 genes influence the risk of graft rejection in kidney transplant recipients taking mycophenolate mofetil[J]. Mutation Research/genetic Toxicology & Environmental Mutagenesis, 2018, 836: 97-102.

[55]KAMES JH, RETTIE AE, SOMOGYI AA, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2C9 and HLA-B Genotypes and Phenytoin Dosing: 2020 Update. Clin Pharmacol Ther. 2021,109(2):302-9

[56]HICKS JK, BISHOP JR, SANGKUHL K, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium ( CPIC) guideline for CYP2D6 and CYP2C19 genotypes and dosing of selective serotonin reuptake inhibitors. Clin Pharmacol Ther, 2015, 98(2):127-34

[57]SWEN JJ, NIJENHUIS M, DE BOER A, et al. Pharmacogenetics: from bench to byte-an update of guidelines. Clin Pharmacol Ther, 2011, 89(5): 662-73.

[58]STINGL JC, BROCKM LLER J, VIVIANI R.Genetic variability of drug-metabolizing enzymes: the dual impact on psychiatric therapy and regulation of brain function. Mol Psychiatry, 2013, 18(3):273 - 87

[60]CAUDLE KE, RETTIE AE, WHIRL-CARRILLO M, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Guidelines for CYP2C9 and HLA-B Genotypes and Phenytoin Dosin. Clin Pharmacol Ther, 2014, 96(5): 5428.

[61]WANG Q, ZHOU JQ, ZHOU LM, et al. Associationbetween HLA-B*1502 allele and carbamazepine-inducedsevere cutaneous adverse reactions in Han people of southern China mainland. Seizure, 2011, 20(6):446-8.

[62]YANG Y, ZHOU MM, HU M, et al. UGT1A1*6 and UGT1A1*28 polymorphisms are correlated with irinotecan‐induced toxicity: A meta‐analysis[J]. Asia‐Pacific Journal of Clinical Oncology, 2018, 14(5): e479-89.

[63]中国临床肿瘤学会指南工作委员会.中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌诊疗指南2019[M]. 北京:人民卫生出版社, 2019: 72-3.

[64]MULDER T, WITH MD, RE MD, et al. Clinical CYP2D6 Genotyping to Personalize Adjuvant Tamoxifen Treatment in ER-Positive Breast Cancer Patients: Current Status of a Controversy[J]. Cancers, 2021, 13(4):771-85.

[65]马昕驰,张娜.CYP2D6基因型多态性及其对他莫昔芬治疗的影响研讨停顿[J].肿瘤学杂志，2020, 26(06): 528-33.

[66]AMSTUTZ U, HENRICKS LM, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for Dihydropyrimidine Dehydrogenase Genotype and Fluoropyrimidine Dosing: 2017 Update[J]. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2018, 103(2): 210-6.

[67]DENG X, HOU J, DENG Q, et al. Predictive value of clinical toxicities of chemotherapy with fluoropyrimidines and oxaliplatin in colorectal cancer by DPYD and GSTP1 gene polymorphisms[J]. World J Surg Oncol. 2020, 18(1): 321-30.

[68]HASHIGUCHI M, TSURU T, MIYAWAKI K, et al. Preliminary study for predicting better methotrexate efficacy in Japanese patients with rheumatoid arthritis[J]. Journal of Pharmaceutical Health Care & Sciences, 2016, 2(1): 1-7.

[69]GHODKE-PURANGIK Y, PURANIK AS, SHINTRE P, et al. Folate metabolic pathway single nucleotide polymorphisms: a predictive pharmacogenetic marker of methotrexate response in Indian (Asian) patients with rheumatoid arthritis[J]. Pharmacogenomics,2015, 16(18): 2019-34.

[70]MORIYAMA B , OBENG A O , BARBARINO J , et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guidelines for CYP2C19 and Voriconazole Therapy[J]. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2016, 102.

[71]LIMA JJ , THOMAS CD , J BARBARINO, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2C19 and Proton Pump Inhibitor Dosing[J]. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2020.

[72]THEKEN KN, LEE CR, GONG L,et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Guideline (CPIC) for CYP2C9 and Nonsteroidal Anti-Inflammatory Drugs. Clin Pharmacol Ther, 2020,108(2):191-200.

[73]SADHASIVAM S, BRANDOM BW, HENKER RA, et al. Bayesian modeling to predict malignant hyperthermia susceptibility and pathogenicity of RYR1, CACNA1S and STAC3 variants. Pharmacogenomics, 2019,20(14):989-1003.

[74]GONSALVES SG, DIRKSEN RT, SANGKUHL K, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for the Use of Potent Volatile Anesthetic Agents and Succinylcholine in the Context of RYR1 or CACNA1S Genotypes. Clin Pharmacol Ther, 2019, 105(6):1338-44.

[75]FITZGERALD JD, DALBETH N, MIKULS T, et al. 2020 American College of Rheumatology guideline for the management of gout. Arthritis Rheumatol, 2020,72(6):879-95.

[76]PIRMOHAMED M. Pharmacogenetics: past, present and future[J]. Drug Discov Today ,2011,16:852-61

[77]STUART A. SCOTT. Personalizing medicine with clinical pharmacogenetics[J].Genet Med, 2011,13(12):987-95.

[78]SOLOMON M.A., KARRYN R.C, PHILIP E.E.Clinical Pharmacogenomics Applications in Nephrology[J].Clin J Am Soc Nephrol, 2018,13:1-11.

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